BioJulia系列-PhyloNetworks包

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文献要点

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  • 系统发生网络比系统发生树能更好地代表物种演化信息, 推荐[:两个综述]

  • 系统发生网络可以展示杂交、渗入、水平转移信息

  • 系统发生网络几个属性:

    • hybrid nodes

    • branch length

    • inheritance probability γ: 基因组上发生hybrid的比例

    • minor hybrid edges: PhyloNetworks定义的概念, γ < 0.5的hybrid edge;

    • major hybrid edges: PhyloNetworks定义的概念, γ > 0.5的hybrid edge;

包的使用



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